由于本作游戏进行的路线过多，故本人只写出我初次通关路线，欢迎大家交流各自的捷径打法。（有些地方可能有重复路线的情况...道好多啊T_T...）
---------------------------EXPERT难度---------------------------
第01段LightHouse：（打法要多变，观察地形最为主要）
任务开始后位于一个小岛岸边，往前走攀上石壁可以从石壁的缝隙中找到一条隐蔽的路，通过之后会在吊桥处遇到2名巡逻士兵。从吊桥左侧的下坡路线走以便避过士兵，通过梯子上到城堡地牢，此处一名士兵在练习枪法，利用黑暗设法解决（发电机可关可不关）。随后顺路一直往阶梯上方走通过一道门来到一间刑讯室，利用有效的工具或者武力解决守卫士兵后将俘虏救下（好像已经嗝屁了...）。通过一扇上了锁的门，来到一个帐篷前，利用刀割开帐篷进入内部将里面一名守卫干掉，再利用黑暗解决外面的守卫。通过一边的通道前往另一个区域，此处有两名士兵在交谈，当2人分开后，利用黑暗的掩护分别将其干掉，随后通过爬上一个瓦棚，借由瓦棚跳到木板桥上继续前进。来到一间了望室，此处有一名士兵在了望ing...干掉后使用后面的电脑，随后继续前进。通过里面的出口来到城堡的炮台，此处有2名士兵在交谈，利用监控烟雾可以轻松解决。往下走会遇到一名士兵在焊接门板，干掉后继续往下走。在一浮桥处解决一名士兵后，到达灯塔门前利用踢门解决门内侧的守卫后，向灯塔顶楼进发，在塔楼中心位置的补血点旁边的一柜子内可以拿到文件，随后到塔顶解决守卫士兵呼叫总部便可通过此段。
第02段GargoShip：（本段流程可乱序而行）
任务开始后位于一艘轮船上，先解决眼前的3名守卫。到达DECK S-1通过这里的木箱间的隙缝可以找到通路到达S2B。在一间有切割机的房间内解决里面的船员后爬上切割机右上方的排气通道内到达一间机械室，解决里面2名士兵后调查控制台。随后到达DECK S-3一定要用暗杀解决内部的守卫，通过管道爬上阶梯，然后上到最顶层。通过顶层的一个阶梯来到一间档案室，门口有通风口可以绕到另一侧，干掉里面的守卫，调查电脑并找到柜子里的文件。随后往里继续前进路过医疗室的时候记得调查里面的电脑，接着从阶梯上到2层，上去前在阶梯下面的箱子处安装追踪器。进入2层餐厅，解决里面的守卫并在后厨的房间一个箱子上安装追踪器，往里走的一扇门可以通往一处阶梯，通过阶梯可以上到轮船顶层的操舵室，再此之前解决掉这个区域房间内的3名守兵，并在走廊一处箱子前安装追踪器。随后到达操舵室，从操舵室内轮船右舷方向的门出去，解决附近的3名守卫，进入DECK - 5操作里面的电脑，然后到船尾处一处箱子上安装追踪器，接着返回档案室方向下层的一条先前没有去过的路线，到达最里面的一处箱子前安装追踪器。接着返回到开始不久路过的S2C仓库，进入后到上面放着红色小箱子的箱子前调查，最后到达船尾上面放着救生艇的地方便可通过此段。
第03段Bank：（破解密码不一定要靠实力，运气也很重要。）
任务开始后位于一个大宅子的花园中，先解决园中的3名守卫然后不要进楼，从小路绕到楼后面的梯子处，通过梯子到楼顶的一间房间内打开楼顶天盖的开关，随后通过打开了的盖子进入大楼内部。随后利用打爆物体来吸引守卫关掉激光进来，干掉守卫后往内部前进。左侧的门先不要进入，先从右侧的电子门进入，途中要多注意墙上的监视器，要用电子干扰解决。将内部可到之处的敌人都解决掉，可调查的电脑和特殊开关都调查完后再从先前左侧的门进入。利用电子干扰解决监视器后，引出一名守卫，将其解决后再破解监控台的大门密码，随后进入内部解决另一名守卫，并调查电脑，随后通过此处往大楼内部前进。来到2楼会遇到一名守卫，不要急于干掉他，跟在他的后面走可以躲过激光的扫描（或者抱着他的尸体...），通过激光后再将其干掉，里面的另一个守卫也用这个方法对付。随后来到一个玻璃建造的办公室边，小心墙上的监视器，利用烟雾解决掉2个正在里面办公的守卫，然后调查电脑并关闭监视器总开关。通过前面的一个密码门到最里面调查电脑和一个控制开关，然后从阳台那里跳下去，通过之前从右侧门通过时一处监控间旁边无法进入的门。先来到一间储物室调查储物柜拿取东西，然后再往下走。来到保险库，分别在2处钥匙空安装破锁道具，然后进行撬锁画面，每次当3盏灯变成绿色时才可以开启一个方向的锁尺，否则会再重新输入一遍。当输入完毕后到金库门前安装电子炸弹，后退几步后引爆便可以进入内部调查电脑，接着拿到玻璃柜内的物品从天盖那条路线撤离到开始地点便可通过此段。
《细胞分裂3》通关路线攻略
第04段PentHouse：
任务开始后位于城市中一条小巷，先解决面前的4名守卫。随后进入大楼内部，通过电梯上到顶层直升机坪，到左侧关闭灯的电源以便解决或者躲避守卫，然后到对面梯子处通过缆绳荡到对面的大楼。解决在阳台巡逻的守卫后进入大楼内部，利用右边的通风管道躲过守卫或者伺机干掉守卫，继续往里走先搞定睡觉的守卫并调查电脑随后在前面阶梯下的监视器处安装监控道具，通过阶梯第2层左侧的门，解决里面听收音机的敌人时要注意阳台巡逻的2名守卫和监视器，在监视器处安装监控道具并解决守卫后继续深入。先解决内部螺旋阶梯下的士兵和在附近2处监视器上安装监控道具，再到上层监视器处安装监控道具，随后往里解决门另一侧的2名守卫，开门后再将门口上方的监视器上安装监控道具。随后返回到之前2层右侧的门，前往另一个区域。利用2层窗户下的一间矮房可以爬到2层，要注意上面的动作捕捉炸弹，轻轻的过去在其闪绿灯的时候将其拆下。随后还要在途中拆下几个，在1层一处电子门内会与接头人会面，随后到屋内一控制台前启动开关，这时身边的6台机器会开始闪光，依次到闪绿光的机器前按下开关便可以使其运作，随后到最里边的机器前调查即可。最后返回到2层左侧门里边一螺旋阶梯右边一处废旧电梯里即可通过此段。
第05段Displace：
任务开始后位于前一段大楼的通风管道处，往前走将发电开关处的2名守卫解决，随后到里面关掉大楼通风扇的电力供应，接着从通风扇口处放下绳子下去。到达一间会议室的上方后不要着急下去，用探头观察里面情况，当里面的重要人物离开后再下去。随后往里来到一间大的电脑室调查开机的电脑。随后从这间房子下面的通路通过一处电子门，这里会遇到先前的重要人物，不要打草惊蛇，悄悄的跟着他们来到电脑室。当其中拿箱子的一方单独走开后悄悄的跟上去，当他到达一间房间后将其抓住训话随后打晕，解读他的密码箱。随后从此房间往右侧的电子门出去上楼，通过上层左侧的未知区域，这里有3道门，左侧为一个健身房，右侧为一个布满激光的通道和一间卫生间，到健身房里解决2名守卫，随后带着一个人的身体通过右侧有激光的通道，因为守卫自身有身份验证，所以激光便会消失。到达内部后先解决左边2名守卫和右边控制台前的守卫，随后到楼梯上层房间内调查电脑。完成后从房间下方的通风管道进入，往右侧方向爬，利用绳子下到下面的控制机房调查电脑,调查完后迅速返回上面管道，此时会有守卫进入操作电脑，趁其不备时下去将其制服，接着再解决外面的一名守卫。随后往里走会回到先前的区域Level - 1，但是一处电梯可以使用了。利用电梯来到上层区域Level - 3，先解决电梯门口旁边的2名守卫和里面房间内部的2名守卫。随后通过有监视器的电子门，来到一处办公区域，里面一间有密码门的房间内部的电脑有重要资料，调查完后通过这层的另一扇电子门来到楼梯间，到达顶层便可以通过此段。
第06段Hokkaido：
任务开始后位于一崖边，先爆了上面一个守卫，然后进入据点内部。解决汽车前的2名守卫，然后到2辆汽车尾部扫描汽车牌照。进入宅子，随后的路线很简单，解决路上的守卫。通过一屋内的卫生间右侧下面的通风管道来到一处庭院，解决区域内闲杂人等，进入另一栋宅子。在一屋内有4个人在交谈，其中一个穿着西服的人是重要人物，通过房间下面的小通道爬到另一边躲起来，等待时机解决守卫然后挟持重要人物训话，随后通过大佛左后方墙上的通风管道来到下一个区域。通过阶梯来到2层，从里侧一处小仓库的通风口爬到一屋顶，此处可以看到对面房间内2个人影在交谈。解决门前的守卫，这时谈判双方其中一方会拿刀杀死对方并逃跑，迅速向此人追击，当追至开始所到的停车的地方时此人早已坐直升机浮云了，之后只需原路返回到出发点便可通过此段。
《细胞分裂3》通关路线攻略
第07段Battery：
任务开始后位于一仓库上方的通风设施里，利用绳索下到仓库内部，先解决眼前的2个守卫，随后进入据点内部。利用电子干扰干扰监视器运作，然后趁此时机破解密码门，通过后再将巡逻的守卫干掉，随后再解决里面3名守卫。解决在导弹运送车旁的2名守卫，到车左边的控制板处调查，此时导弹会被运送走，跳上运送带攀爬到对面炮弹存放处。从上面下来后会看到一个井盖打开，下去利用调查控制板使左右两侧的升降铲上升，随后先从右侧的出口出去来到导弹库，解决里面的守卫和监视器后调查一颗露出弹头的导弹，随后进入控制室内调查电脑，之后到另一侧的导弹库，同样的解决守卫，弹头和电脑。完成后到电梯处，来到上层开门解决门口守卫，前方检测门左侧的通道是可以连到电梯上房的此处可以避免一些不必要的交火。往右侧走会碰到3名守卫和一名上司，先不要急于过去，等上司把其中一名守卫干掉后各自回到自己的岗位后，先分而解决2名守卫并调查电脑，然后找机会挟持上司训话，完成后干掉他调查他的电脑。随后到下层电梯左侧的导弹库，这时里侧的升降门升起，解决内部的守卫通过一段隧道来到一处导弹发射架，从下面的门来到发射台下方的房间，解决内部的2名守卫后后调查电脑和控制板，随后上面发射架的后面板会打开，此时过去调查。完成后会响起警报，这时向电梯右侧的导弹库前进，干掉守卫后通过一