第一章：逃出虎口
前言：简森在钟楼炸了船坞之后搭上了前往敌人秘密巢穴的轮船并进入冷却仓企图潜行过去，不过在船上被船员发现，最后被他们剥光装备囚禁起来。一个最新技术的作战型强化人，他们不知道简森的身份，只能先把简森关起来并派人看守，等到达目的地之后再作打算。
主线任务：getting out of the frying pan（逃离虎口）
任务攻略
一：escape and find my equipment（逃离并找到装备）。
1：从门口出去后对面门外有两个敌人，锁是一级HANK，可以打开；不过这里墙角有个通风口，就在箱子下面。从通风口出去或走门把这两个敌人按Q键击晕。
2：按照小地图黄色标示来到一个通道，前面有两个敌人和一个摄像头，这里你可以引诱他们一下然后进入通道边上的房间，从房间那张麻将桌上面的通风口出去；也可以直接用前面击晕敌人捡来的手枪杀出去。
3：看到一个梯子，上去后等巡逻的敌人过来击晕之。从后面走，来到一个门前，这门是开着的，前面有敌人要小心；可以把门关上，拿箱子再墙上垫一下从墙上的通风口出去，当然也可杀出去。
4：从通风口出去后来到另一个通风口，进去后走一段发现前面漏电；先从前面的开口上去把在箱子后面的电闸关了，然后再下去。来到目的地，装上装备，加好强化点。
二：locate the cic（找到CIC）
1：穿上装备后简森发现有人联系自己，不过信号非常不好，可能是普里查德，所以简森决定前去轮船的中央机房使用通信设备。
2：按M打开地图，发现任务在楼上，通过梯子一路爬上去；这里也有个支线任务，任务地点在楼下。上去后来到甲板，小心解决落单的敌人，这时你完成了第一个主线任务有很多强化点，加上以后可以轻松过去了。
3：来到中央机房，和神秘人联系。
三：locate the sally port（找到突破口）
1：发现和自己联系的不是普里查德，而是一个自称意外逃生的人；简森准备相信他去轮船的货舱处寻找出去的路。
2：下去后放下吊床，注意前面一节货厢内有把突击枪；前面有几个敌人和一个机器人，幸好我前面找到了一个磁浮手雷；我因为没有加隐身，只能杀过去，把敌人都杀了之后等机器人过来一颗磁浮手雷搞定。
3：进去后前面2楼有敌人，也有一间控制室；把控制室中的机器人碉堡关了或转化为友军。在前面地上有两个警报装置，在警报时千万不要上去，不然会被射成马蜂窝；等警报解除之后两个警报装置会自动下沉，这时再过去。
4：最后按小地图提示找到一个地下小洞，进去后碰到前面认识的女中尉。第一个主线任务完成。
第二章：肚子里的野兽
前言：简森碰到了女中尉，一番交谈后了解到中尉原来是个卧底，她发现这里在偷偷做着一些黑项目，涉及到一些科学家和囚犯。半年前来了一些特备行动小队，他们非常神秘；由于这里每个人都被紧紧的监视着，所以中尉让简森深入看看到底发生了什么。
主线任务：in the belly of the beast （肚子里的野兽）
任务攻略
一：upload my biometrics on the prison’s mainframe computer（在监狱的电脑主机上上传中尉的生物识别技术）
1：接完任务后按小地图行动，这里同时接到了一个支线任务，去支线任务的地方，达到目的地对话完全后这个人是商人，可以买卖东西。话说这人好有型···（这里也可以买到强化点）
2：按提示一路走，来到一楼监狱的电脑主机间，这里不难。在电脑主机上装上中尉的生物识别器。
二：investigate the interrogation wing（调查审讯间）
1：上传中尉的生物识别技术后中尉让简森前去审讯间调查，并找出BURKE的藏身之地。
2：这个任务在楼上，楼上有两架机器人，前面监狱的电脑主机边有个控制电脑，不过要4级HANK；我是直接用地雷加爆炸手雷合成地雷手雷；然后一个一发解决。
3：这里必须要经过一个警报装置，不要碰到红线过去。之后来到目的地，和双面女间谍交谈，之后来到目的地触发动画。他们知道有人入侵了，而且他们貌似在做一个人体生物和神经系统上的实验，很多囚犯当做试验品死了。
三：retrieve burke’s eye+give burke’s eye to quinn（搜索BURKE的假眼并把假眼带回给quinn）
1：简森看到他们坐电梯下去了，想要跟下去必须拿到BURKE的假眼骗过电梯的侦测。按照小地图拿到假眼，这里敌人很少，而且一边都来过好几趟了，几乎可以随便走。
2：拿到假眼后接到后续，把假眼带回给那个商人；给商人后经过改装在回来开门（蛋疼···）。
3：通过假眼下去后碰到前面出现过的女博士。女博士和简森交谈后发现原来他们在做的研究并非为了救人，而这里很难逃出去，BURKE已经回到基地去了。
第三章：选择
前言：简森和女博士交谈后女博士同意做国际刑警组织的证人，不过在基地有BURKE和他的团队在，所以简森决定先回去基地解决麻烦。
主线任务：choices ，choices （选择）
任务攻略
一：get kavanagh off the base（保护女博士安全离开）
1：简森坐电梯上去时突然发生意外，通信后了解是BURKE知道了他们的行动，所以简森要速度回去支援。从电梯出去后先从楼梯爬上去，有些楼梯看不到要先跳上箱子，一点点上去。
2：最后梯子上去后通过通风口出去，进入内部；发现3个敌人守在大门，可以用台风爆炸系统杀之或者也可以直接从边门过去不管他们。碰到女中尉，BURKE已经知道她的身份。
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